FUNGREEN

Contribución de los micobiomas ambientales al exposoma urbano en espacios verdes y edificios [Contribution of environmental mycobiomes to the urban exposome at greenspaces and buildings]

Entidad Financiadora: Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades / Agencia Estatal de Investigación, Ref. PID2025-173237NB-I00.

Duración: 01/09/2025 – 31/08/2028

Fondos: 192.125 €.

Resumen:

Estudios previos han destacado los múltiples beneficios de los espacios verdes urbanos, entre ellos, la mejora de la calidad del aire y del microclima de las ciudades, los servicios ecosistémicos que proporcionan, así como sus efectos positivos sobre la salud y el bienestar mental de los ciudadanos. La “hipótesis de la biodiversidad” establece que la exposición a ambientes naturales, como por ejemplo los espacios verdes, puede modificar y enriquecer el microbioma humano (bacterias, hongos y virus que habitan en nuestros cuerpos), promoviendo el equilibrio inmunológico y protegiéndonos de ciertas enfermedades como las alergias y los trastornos inflamatorios. Hasta la fecha, las investigaciones que han estudiado cómo afectan los espacios verdes al microbioma humano se han centrado exclusivamente en las comunidades bacterianas, mientras que las comunidades fúngicas de estos ambientes urbanos (el micobioma de los espacios verdes) y su papel sobre la exposición y salud humana aún no se ha abordado. Del mismo modo, cuando se investiga sobre la resistencia a los antibióticos, una de las principales amenazas actuales para la salud de la humanidad, los estudios fúngicos quedan desatendidos en gran medida.

Por ello, con el objeto de paliar estas lagunas de conocimiento, el proyecto FUNGREEN estudiará los micobiomas urbanos asociados a espacios verdes y edificios de la Península Ibérica (15 estaciones experimentales en 12 ciudades), con una atención especial a la resistencia del patógeno oportunista Aspergillus fumigatus frente a los tratamientos con azoles. Se analizarán numerosas muestras ambientales (aire/esporas, polvo, suelo y compost) y aislados fúngicos usando diversos métodos (técnicas de DNA ambiental, cultivo, susceptibilidad a antifúngicos, genotipado, ensayos de micotoxinas y citotoxicidad) para abordar los cuatro objetivos principales del proyecto: (1) conocer la conexión entre los micobiomas de los espacios verdes urbanos y aquellos presentes en los edificios cercanos, (2) identificar posibles indicadores fúngicos que sean útiles para evaluar la exposición humana en ambientes urbanos, (3) conocer la distribución de A. fumigatus en ambientes urbanos de España y Portugal, y (4) estudiar el problema de la resistencia a los fármacos antifúngicos en las poblaciones urbanas de A. fumigatus.

Además de llevar a cabo un plan integral de comunicación científica, a través de la asistencia a congresos internacionales y publicaciones en revistas de alto impacto, el proyecto FUNGREEN planea una serie de actividades de divulgación, tales como seminarios en institutos de educación secundaria y la participación del equipo del proyecto en diferentes eventos públicos locales e internacionales, lo que permitirá difundir la importancia de la microbiología ambiental y sus beneficios para la sociedad entre la población más joven. Los resultados previstos del proyecto tendrán un impacto notable sobre ciertas áreas científicas: microbiología de ambientes construidos, exposición humana, salud pública, microbiología clínica, epidemiología y divulgación científica. A medio o largo plazo, este proyecto también contribuirá a desafíos globales para la sociedad, como son la creación de ambientes más saludables en nuestras ciudades y el control de alergias, casos de asma, resistencia a los antimicrobianos y los “supermicrobios”, lo cuales se han incrementado en los últimos años.

Summary:

Previous studies have recognized the multiple benefits of urban greenspaces on air quality and microclimatic conditions of cities, ecosystem services, as well as health and mental wellbeing of citizens. The “biodiversity hypothesis” states that exposure to natural environments such as greenspaces may shape and enrich the human microbiota (i.e., bacteria, fungi and viruses inhabiting our bodies), promoting immune balance and protecting from allergy and inflammatory disorders. To date, investigation about greenspaces’ effects on human microbiota has exclusively focused on bacteria, while the fungal communities of these urban environments (greenspace mycobiome), and their role on human exposure and health, have been unexplored. Similar lack occurs with the fungal research on antimicrobial resistance, despite of its important contribution to this global health threat that is currently facing the humankind.

To fill these key knowledge gaps, FUNGREEN project will study the urban mycobiomes in greenspaces and nearby buildings from the Iberian Peninsula (15 experimental stations in 12 cities), with an especial focus on the azole resistance of the opportunistic pathogen Aspergillus fumigatus. Numerous environmental samples (air/spore, dust, soil and compost) and fungal isolates will be analysed using a combined approach (eDNA, cultivation, antifungal susceptibility, genotyping, mycotoxins and cytotoxicity assays) to address four main objectives: (1) to know the connections between the mycobiomes of urban greenspaces and their nearby buildings, (2) to identify potential fungal indicators to assess human exposure in urban environments, covering both negative and positive health effects of mycobiomes, (3) to know the distribution of A. fumigatus in urban environments from Spain and Portugal, and (4) to study the antifungal drug resistance problem in the urban populations of A. fumigatus.

In addition to a comprehensive scientific communication plan, through attendance to international conferences and publications in high-impact journals, FUNGREEN project plans diverse outreach activities, such as seminars at high schools and participation in local and international public events, to promote the environmental microbiology research and its benefits to society between the youngest citizen. The expected project outputs will have notable impact on scientific areas such as microbiology of the built environment, human exposure and public health, clinical microbiology, epidemiology and science communication. In the medium- or long-term, this project will also contribute to some global societal challenges such as promoting healthier environments in our cities, and controlling the increasing allergies, asthma cases, antimicrobial resistance and the emerging “superbugs”.

Infographic detailing sampling design and methodological approaches to address the main FUNGREEN’s objectives (in green).

Participant(e)s:

Pedro M. Martín Sánchez (Investigador Principal; grupo MAPC)
Leonila Laiz Trobajo (Equipo de Investigación, grupo MAPC)
Rafael López Núñez (Equipo de Investigación, grupo SOILPLANT)
Manuel Delgado Baquerizo (Colaborador, grupo BioFunLab)
Emilia Mellado Terrado (Equipo de Investigación; Laboratorio de Referencia de Investigación en Micología, CNM, Madrid)
Carla Viegas (Equipo de Trabajo; Lisbon School of Health, IPL, Lisbon, Portugal)