Microbiología Ambiental y Patrimonio Cultural

Recientemente se ha publicado en acceso abierto dos nuevos artículos del proyecto Mycospitalomics, firmados por miembros del grupo MAPC y la profesora Emilia Mellado del Instituto de Salud Carlos III.

En primer lugar, el trabajo publicado en la revista Microbial Ecology, titulado “Contribution of DNA metabarcoding to the environmental fungal assessments in hospitals”, muestra los resultados de los análisis de ADN ambiental de >200 muestras (aire, superficies, polvo y suelo) recogidas de tres hospitales españoles. El uso de la técnica DNA metabarcoding reveló un inventario de hongos de hospitales mucho más completo que el obtenido mediante técnicas de cultivo, con representantes de 4 filos fúngicos (principalmente Ascomycota y Basidiomycota), 35 clases, 114 órdenes, 305 familias, 643 géneros y 535 especies. Sin embargo, ambas aproximaciones metodológicas coinciden en los mismos géneros dominantes en muestras de aire y superficies: Cladosporium, Alternaria, Aureobasidium, Penicillium, Neodidymelliopsis, Aspergillus, Pseudopithomyces y Stemphylium. Levaduras de los géneros Candida y Clavispora fueron particularmente abundantes en muestras de superficies que tienen un contacto directo con los pacientes y personal sanitario, por ejemplo, asientos, mostradores y pantallas táctiles de las salas de espera, así como en barandillas de camas, mesillas de noche y equipamiento sanitario de habitaciones de pacientes y unidades de cuidados intensivos. La estructura de la comunidad fúngica resultante estuvo principalmente influenciada por las siguientes variables del estudio: hospital y zona donde se recogieron las muestras, tipo de muestra y campaña de muestreo.

Por otro lado, la publicación de la revista Journal of Fungi, titulada “An integrated analysis approach to unravel the Aspergillus community in the hospital environment”, se centra en el los resultados referentes al género Aspergillus, por su relevancia clínica para los pacientes inmunodeprimidos.A pesar de la alta prevalencia de este género, presente en muestras de aire y superficie de casi todas las zonas interiores de los tres hospitales del estudio, su abundancia relativa respecto el total de hongos detectados fue limitada y dependiente de los métodos utilizados, con valores medios que oscilaron entre el 1,4% por DNA metabarcoding, el 6,8% por métodos generales de cultivo (incubación a 28 °C) y el 28,3% por cultivo selectivo (incubación a 37 °C).

Cabe destacar que el estudio de DNA metabarcoding detectó una mayor proporción de secuencias de Aspergillus las zonas más protegidas (UCIs), lo que implica un riesgo importante para los pacientes críticos que allí reciben tratamiento. Un total de 32 especies de Aspergillus fueron identificadas molecularmente, incluyendo A. fumigatus, A. flavus, A. terreus, A. niger, A. oryzae, A. sydowii y A. tubingensis, las cuales pueden causar infecciones pulmonares invasivas como.

Estos estudios ilustran la importancia de realizar los controles periódicos de los hongos que habitan en ambientes hospitalarios, incluyendo análisis cuantitativos de la carga fúngica y una caracterización taxonómica de la comunidad.