Etiqueta: comunidades microbianas

Comienza el proyecto FUNGREEN que avanzará el conocimiento del micobioma urbano y su impacto sobre la salud

El pasado 15 de octubre tuvo lugar la reunión de lanzamiento de FUNGREEN, el nuevo Proyecto de Generación de Conocimiento que coordina el grupo MAPC (IP: Pedro Martín Sánchez), en colaboración con los grupos SOILPLANT y BioFunLab del IRNAS, el Instituto de Salud Carlos III y el Instituto Politécnico de Lisboa.

FUNGREEN estudiará las comunidades de hongos (micobiomas) presentes en espacios verdes urbanos, así como su influencia sobre los edificios cercanos, en 12 ciudades de España y Portugal. Con ello se pretende identificar indicadores fúngicos que resulten útiles para evaluar la exposición humana en diversos ambientes urbanos, prestando una atención especial a la distribución del patógeno oportunista Aspergillus fumigatus y sus mecanismos de resistencia a los compuestos antifúngicos.

Conocer más detalles sobre este proyecto

Infografía que ilustra el diseño experimental y los enfoques metodológicos planeados para abordar los objetivos del proyecto FUNGREEN (en verde)

Nos unimos a la Conexión-MICROBIOMA

El grupo Microbiología Ambiental y Patrimonio Cultural forma parte de la Conexión-MICROBIOMA desde su inicio el pasado 7 de marzo de 2025.

La Conexión-MICROBIOMA es una red de colaboración científica de nueva creación que agrupa más de 90 investigadores de 50 grupos de más de 40 institutos del CSIC. La conexión orienta su actuación a la formulación y coordinación de programas, proyectos, propuestas y actividades conjuntas, así como a la internacionalización y especialización de sus miembros.

Los participantes en esta red aportan una experiencia consolidada y altamente especializada en el estudio de los microbiomas humanos (intestinal, oral, vaginal, pulmonar y de leche materna), animales, acuáticos (marinos y de agua dulce), terrestres (suelo y rizosfera), microbiomas de alimentos fermentados y de entornos construidos y subterráneos. Su labor abarca desde la investigación básica hasta aplicaciones en sectores clave como la salud, agricultura, medioambiente, biotecnología, farmacéutica y patrimonio cultural.

La misión principal de la Conexión-MICROBIOMA es unificar y potenciar el conocimiento y los recursos sobre los microbiomas —los billones de microorganismos, y sus genes, que habitan en los seres humanos, animales y el medioambiente— para posicionar al CSIC como referente internacional en investigación multidisciplinar. Esta iniciativa promueve la colaboración entre grupos científicos y sectores estratégicos, con el objetivo de contribuir a la mejora de la salud humana y ambiental, la agroalimentación, la biotecnología y otros ámbitos clave para la sociedad.

Los objetivos de la Conexión-MICROBIOMA incluyen

Fomentar la conexión y colaboración entre investigadores CSIC en el ámbito del microbioma.

Crear y mantener un catálogo de recursos y capacidades del CSIC en microbioma.

Promover la formación y atraer talento nacional e internacional en microbioma.

Incrementar la visibilidad global del CSIC en investigación sobre microbioma.

Facilitar la aplicación de los avances del microbioma en sectores clave.

El tipo de edificio y su uso determina qué hongos lo habitan

Un estudio en colaboración con la Universidad de Oslo ha sido recientemente publicado en la revista Microbial Ecology (“Yeasts Prefer Daycares and Molds Prefer Private Homes” firmado por Kauserud, Martin-Sanchez y colaboradores). Esta publicación recoge los principales resultados de dos estudios de ciencia ciudadana sobre las comunidades fúngicas que habitan en cientos de viviendas y guarderías noruegas, los cuales están relacionados con los proyectos MycoIndoor y Mycospitalomics.

Los resultados, basados en análisis DNA metabarcoding de muestras de polvo, mostraron una diversidad fúngica similar en ambos tipos de edificios. Sin embargo, proporcionalmente, las comunidades de las viviendas presentaron una mayor abundancia de mohos filamentosos, pertenecientes a los géneros Aspergillus, Penicillum y Cladosporium; mientras que diferentes levaduras, clasificadas en los órdenes Saccharomycetales, Filobasidiales y Tremellales, mostraron una mayor proporción en las guarderías. Estos hallazgos plantean la necesidad de realizar futuros estudios sobre las posibles implicaciones que pueden tener algunos de estos hongos para la salud de los habitantes.

Nuevo estudio publicado sobre las comunidades fúngicas presentes en hospitales

Graphical abstract

Se ha publicado en acceso abierto en la revista Building and Environment el artículo titulado “Fungal burden assessment in hospital zones with different protection degrees”, firmado por Laura García-Gutiérrez, Belén Baena Rojas, Maite Ruiz, Sara Hernández Egido, Alba Ruiz-Gaitán, Leonila Laiz, Javier Pemán, Marisol Cuétara-García, Emilia Mellado, y Pedro Martin-Sanchez. Esta publicación recoge los principales resultados de los muestreos estacionales (invierno y otoño del 2023) llevados a cabo en tres hospitales españoles: Virgen del Rocío en Sevilla, La Fe en Valencia y Severo Ochoa en Leganés; asociados al proyecto Mycospitalomics del Plan Nacional (PID2021-123184OA-I00).

Independientemente del hospital de estudio y de la estación del año, se observó un claro gradiente en la carga fúngica del aire, que aumenta desde las zonas más protegidas (unidades de cuidados intensivos equipadas con filtros de aire HEPA) hasta las zonas más expuestas al ambiente exterior en las que también hay un mayor número de pacientes y visitantes (zonas de admisión y salas de espera), observándose una carga intermedia en las habitaciones de pacientes en planta.

El estudio, basado en métodos de cultivo con la posterior identificación molecular de los aislados, ha mostrado una elevada diversidad fúngica (74 géneros) en los hospitales muestreados, dominada por hongos filamentosos que son frecuentes en el aire de los edificios (Cladosporium, Penicillium, Aspergillus, Alternaria y Aureobasidium), y levaduras que suelen asociarse a la piel de sus ocupantes (Naganishia, Moliniella, Rhodotorula y Filobasidium). Además, 36 de las especies identificadas han sido anteriormente descritas en la literatura como potenciales patógenos oportunistas de humanos.

Un total de 508 cepas de hongos aisladas de hospitales (69% del aire y 31% de superficies) han sido conservadas en la colección de cultivos del grupo MAPC, las cuales suponen un valioso recurso para futuras investigaciones donde se combinen las áreas de micología ambiental y micología clínica.

Cuatro comunicaciones del grupo en el 12th International Mycological Congress (IMC12)

El decimosegundo Congreso Micológico Internacional (IMC12), que ha tenido lugar entre los días 11 y 15 del pasado mes de agosto ha permitido que el grupo Microbiología Ambiental y Patrimonio Cultural tenga la oportunidad de presentar las comunicaciones tituladas

Bats and arthropods influence fungal diversity in gypsum cave biofilms, de V. Jurado, P.M. Martin-Sanchez, T. Martin-Pozas, A. Fernandez-Cortes, J.M. Calaforra, S. Sanchez-Moral, A. Cotan-Garcia y C. Saiz-Jimenez;

Fungal diversity in daycare centers and private homes – yeast play in daycares while the molds stay at home, de H. Kauserud, P.M. Martin-Sanchez, E.L. Estensmo, S. Botnen, L. Morgado, S. Maurice, K. Høiland e I. Skrede;

Hospital-mycobiome monitoring to prevent the nosocomial invasive fungal infections, de P.M. Martin-Sanchez, L. García-Gutiérrez, B. Baena Rojas, M. Ruiz, S. Hernández Egido, A.C. Ruíz-Gaitán, H. Kauserud, D. Peris, J. Pemán y M.S. Cuétara-García; y

New niches for roof-inhabiting cousins: diversity of black fungi on technosphere surfaces, de A.A. Gorbushina, K. Abdallah, D. Enning, R. Gerrits, P.M. Martin-Sanchez, L. Selbmann y L. Schumacher,

bajo la forma de tres comunicaciones orales y un póster. Las comunicaciones recogen los trabajos llevados a cabo en el ámbito de los proyectos de investigación «Geoquímica ambiental y geomicrobiología de las cuevas de yesos de Sorbas, almería y de Italia», ref. PID2020-114978GB-I00, y «Descifrando los micobiomas de hospitales que están asociados a las infecciones fúngicas invasivas y el incremento de la resistencia a los antibióticos», ref. PID2021-123184OA-I00.

Aspecto de una de las sesiones

El 12th International Mycological Congress ha tenido lugar este año en la localidad neerlandesa de Maastritch, organizado por The Dutch Mycological Society (NMV) en colaboración con The Westerdijk Fungal Biodiversity Institute, de la Real Academia de las Artes y las Ciencias de los Países Bajos.

Un trabajo del Grupo, portada del último número de la revista Geosciences

El trabajo «Unraveling the Drivers Controlling the Transient and Seasonal CO2 Dynamic in a Shallow Temperate Cave«, firmado por A. Fernández-Cortés, T. Martín-Pozas, S. cuezva, J.C. Cañaveras, C. Saiz-Jimenez y S. Sánchez-Moral, y publicado en el número 9 del volumen 12 de la revista Geosciences, ha sido seleccionado para la portada de dicho fascículo

En la imagen de portada pueden apreciarse algunos de los espeleotemas estudiados en la cueva de Ardales (Málaga) e incluidos en el trabajo.

Portada del fascículo 9, volumen 12, de Geosciences

El trabajo incide en la importancia de entender la dinámica y la distribución espacial de los gases en las atmósferas subterráneas para aumentar la fiabilidad de los balances de carbono en ecosistemas kársticos o de las reconstrucciones paleoclimáticas basadas en depósitos de cuevas. Esta información es, además, muy valiosa para los gestores de cuevas, tanto para garantizar la seguridad de los visitantes como para la conservación del patrimonio subterráneo.

La investigación que ha dado lugar a la publicación de este trabajo ha sido financiada por el Ministerio de Ciencia e Innovación a través de los proyectos PID2019-110603RB-I00, MCIN/AEI/FEDER UE/ 10.13039/501100011033, y PID2020-114978GB-I00.

El papel de la microbiota subterránea en el ciclo del carbono y el efecto invernadero

Investigadores del grupo de investigación del IRNAS Microbiología Ambiental y Patrimonio Cultural acaban de publicar en Science of the Total Environment, junto a investigadores del Museo Nacional de Ciencias Naturales y las universidades de Amberes, Almería y Alicante, el trabajo titulado «Role of subterranean microbiota in the carbon cycle and greenhouse gas dynamics», en el que se presenta una investigación pionera sobre el papel de la microbiota presente en cuevas en el ciclo global del carbono.

El estudio muestra que los sedimentos de las cuevas promueven contínuamente el consumo de metano de la atmósfera de la cueva, eliminandolo de la misma entre un 65 y un 90%, y que este consumo de metano se debe fundamentalmente a bacterias metanotróficas de las familias Methylomonaceae, Methylomirabilaceae y Methylacidiphilaceae.

Este trabajo confirma por primera vez la existencia de relaciones de dependencia mutua o sintrófica entre el género bacteriano Crossiella y bacterias nitrificantes. Estas relaciones implican el consumo del nitrógeno inorgánico presente en la superficie de los sedimentos, así como inducen la formación de depósitos minerales que fijan el CO2 e intensifican las tasas de oxidación del metano.

Este trabajo ha sido financiado por el Ministerio de Ciencia e Innovación a través de los proyectos PID2019-110603RB-I00, MCIN/AEI/FEDER UE/10.13039/501100011033 , RTI2018-099052-B-I00 y PID2020-114978GB-I00.

Una nueva monografía sobre biodeterioro del Patrimonio Cultural

A mediados del pasado mes de febrero, la editorial suiza MDPI (Multidisciplinary Digital Publishing Institute) publicó en papel la monografía “Microbial Communities in Cutural Heritage and Their Control” (ISBN: 978-3-0365-3050-5), editada por las doctoras Filomena de Leo (Università degli Studi di Messina) y Valme Jurado , miembro del Grupo de Investigación “Microbiología Ambiental y Patrimonio Cutural” del Instituto de Recursos Naturales y Agrobiología de Sevilla.

Portada de la nueva monografía sobre biodeterioro de bienes del Patrimonio Cultural

El volumen recoge 14 contribuciones publicadas originalmente como número especial de la revista Applied Sciences (ISSN: 2076-3417) en las que se detallan diferentes casos de colonización microbiana sobre bienes del Patrimonio Cultural elaborados en una gran variedad de materiales, que van desde distintos tipos de roca a maderas o pinturas de caballete.

Cuatro de los capítulos de esta monografía se dedican a la identificación de microorganismos envueltos en procesos de biodeterioro; otros siete capítulos inciden en el uso de «métodos verdes», de los cuales tres investigan la actividad biocida de productos naturales obtenidos de plantas, y los otros se dedican, respectivamente, a la actividad biocida de barnices combinados con otros productos, a la aplicación de un procedimiento de biolimpieza en granitos, a las potencialidades del control biológico de biofilms fototróficos en cuevas y a la revisión de los métodos antimicrobianos más inovadores, entre los que las nano- y bio-tecnologías juegan un papel importante. Por último, dos capítulos más se dedican a la descripción de métodos para el estudio del biodeterioro.

El libro puede descargarse gratuitamente aquí

Estudio de comunidades microbianas en la Cueva de El Castillo

La Consejería de Universidades, Igualdad, Cultura y Deporte del Gobierno de Cantabria contrató un estudio de las comunidades microbianas responsables de las manchas verdes que cubrían el Panel de las Superposiciones o Panel de Polícromos en la Cueva de El Castillo , (Puente Viesgo, Cantabria) halladas durante las labores de restauración y limpieza realizadas en 2019. Fruto de ese contrato es el informe titulado «Cueva de El Castillo: Estudio de las comunidades microbianas responsables de las manchas verdes que cubren el área de la cueva denominada Panel de las Superposiciones o Panel de Polícromos» realizado por los miembros del grupo de Investigación.

Panel de las Superposiciones de la Cueva del El Castillo

El objetivo del contrato fue determinar las causas y eventuales efectos en las pinturas del Panel de las Superposiciones de la cueva mediante un estudio de las manchas de origen biológico, cuya presencia en las inmediaciones del bisonte rojo y en otras zonas cercanas, en ocasiones en contacto directo con zonas pintadas, implicaba un riesgo biológico que podría afectar a la conservación de las pinturas y al soporte pétreo de diferentes formas.

El trabajo llevado a cabo por el Grupo de Investigación «Microbiología Ambiental y Patrimonio Cultural» consistió en el muestreo, aislamiento, cultivo y extracción de ácidos nucleicos, la secuenciación y el estudio bioinformático de los datos.

El estudio de las muestras de biofilms fototróficos recogidos en el Panel de las Superposiciones y en el suelo adyacente a un foco de iluminación reveló una composición relativamente similar a la de otras cuevas en las mismas circunstancias. La iluminación del panel para su observación ha promovido el desarrollo de algas verdes (clorofitas), tanto en el panel como en el suelo. A juzgar por la composición tanto de procariotas (bacterias y arqueas) como de eucariotas (protozoos y hongos) el establecimiento de la comunidad fototrófica está en sus etapas iniciales y, como se deduce por la colonización y escasa diversidad de unas pocas algas en los dos nichos, no ha progresado mucho. No obstante, se proponen varias medidas para neutralizar el desarrollo de estas biopelículas fotosintéticas sin que la eliminación de los microorganismos fototróficos genere efectos indeseados como el desequilibrio de las comunidades microbianas que pudieran ser la causa de brotes de otros miembros de las comunidades, como sucedió en Lascaux hace unos años.

Estudios para la restauración de la Cruz de la Inquisición, del Ayuntamiento de Sevilla

Miembros del grupo de investigación, en colaboración con el Museo Nacional de Ciencias Naturales y la Universidad de Alicante han llevado a cabo estudios sobre la Cruz de la Inquisición, ubicada en la Plaza de San Francisco, en el ángulo formado por el arquillo y la Sala Capitular Baja del Ayuntamiento de Sevilla, que había sido previamente objeto de vandalismo.

El estudio aportado a la empresa restauradora Samthiago España, Conservación y Restauración de Bienes Culturales, incide en la caracterización y análisis de los materiales de la Cruz, el análisis microbiológico y la identificación de los microorganismos que la habían colonizado.

Desde el punto de vista litológico, se trata de una caliza oolítica/peloidal de grano medio a grueso. Según las clasificaciones más empleadas de rocas carbonáticas se trataría de: Oopelsparita y Grainstone oolítico/peloidal.

La microscopía electrónica de barrido hace patente la existencia de silicatos (arcillas), hollín y minerales sulfatados (yeso, thenardita), además de halita, que parecen indicar una fuerte afectación por contaminación ambiental procedente de los tubos de escapes de vehículos. Los efectos de esta contaminación han sido descritos anteriormente en la piedra de la Catedral de Sevilla, próxima al Ayuntamiento.

En algunas zonas de la parte superficial de las muestras se observa también un profundo deterioro causado por la colonización biológica. La superficie de la piedra muestra abundantes perforaciones (pitting) y acanaladuras producidas por la acción de estructuras biológicas, cuando se observó con el microscopio electrónico.

El estudio microbiológico de las distintas muestras tomadas mostró la existencia de complejas comunidades microbianas en las que cobraban gran importancia las especies fototróficas, como cianobacterias, algas verdes, e incluso algún musgo, si bien no dejaba de haber un componente bacteriano de cierta importancia. Entre las algas se detectaban las especies Prasiola crispa, Gloeotilopsis sterilis o Planctonema lauterborni. Las cianobacterias estaban representadas por Pleurocapsa cf. concharum y Chroococcidiopsis sp. y entre las bacterias se encontraron Kribbella qitaiheensis, Arthrobacter agilis, Rubellimicrobium roseum, Truepera radiovictrix, Geodermatophilus daqingensis, Modestobacter sp., Conexibacter woesei, Rubellimicrobium roseum o Geodermatophilus siccatus.